Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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