Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Usp40Q8BWR4 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Usp40Q8BWR4 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Usp40Q8BWR4 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp40Q8BWR4 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Usp40Q8BWR4 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Usp40Q8BWR4 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Usp40Q8BWR4 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Usp40Q8BWR4 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Usp40Q8BWR4 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp40Q8BWR4 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms