Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NischQ80TM9 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NischQ80TM9 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NischQ80TM9 Abr-201ENSMUST00000065028 4444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NischQ80TM9 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NischQ80TM9 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NischQ80TM9 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NischQ80TM9 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NischQ80TM9 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NischQ80TM9 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NischQ80TM9 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NischQ80TM9 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NischQ80TM9 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NischQ80TM9 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NischQ80TM9 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NischQ80TM9 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NischQ80TM9 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.7 ms