Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap17-204ENSMUST00000205262 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Runx1t1-203ENSMUST00000098257 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
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