Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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