Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Adamtsl3-203ENSMUST00000173287 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Zfp946-201ENSMUST00000088763 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Mbnl3-201ENSMUST00000041495 1803 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Pik3cg-205ENSMUST00000217915 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TrioQ0KL02 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms