Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 9530053A07Rik-204ENSMUST00000150948 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Khdc1a-201ENSMUST00000088407 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms