Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Irx1P81068 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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Irx1P81068 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Irx1P81068 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Irx1P81068 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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