Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms