Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
RxraP28700 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
RxraP28700 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
RxraP28700 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
RxraP28700 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
RxraP28700 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
RxraP28700 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr665-201ENSMUST00000098165 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxraP28700 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms