Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm35392-201ENSMUST00000209934 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
H2-Eb1P04230 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC153864.1-201ENSMUST00000218482 523 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Olfr665-201ENSMUST00000098165 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.9 ms