Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CopeO89079 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm38306-201ENSMUST00000193954 237 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Pisrt1-201ENSMUST00000195532 515 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CopeO89079 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CopeO89079 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CopeO89079 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CopeO89079 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CopeO89079 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CopeO89079 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CopeO89079 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CopeO89079 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CopeO89079 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CopeO89079 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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