Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Q1O19441 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Q1O19441 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms