Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm38306-201ENSMUST00000193954 237 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Pisrt1-201ENSMUST00000195532 515 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms