Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm34597-201ENSMUST00000211189 633 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Wars2-205ENSMUST00000198044 403 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 AC163638.1-201ENSMUST00000224818 392 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20830J3KML6 AC154506.2-201ENSMUST00000225481 1276 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms