Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms