Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Gm5538W4VSP6 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Gm5538W4VSP6 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Gm5538W4VSP6 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm46339-201ENSMUST00000222720 3539 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms