Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm26977-201ENSMUST00000183151 996 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 S100a10-203ENSMUST00000170612 477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Klk1b11-201ENSMUST00000007156 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 n-R5s28-201ENSMUST00000082814 119 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ChmQ9QXG2 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms