Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm43129-201ENSMUST00000201237 603 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC154528.1-201ENSMUST00000228584 527 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Olfr685-201ENSMUST00000051355 1088 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gnpda2-206ENSMUST00000166298 1755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Krt78-201ENSMUST00000164932 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Tro-207ENSMUST00000163969 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm35934-201ENSMUST00000213002 2494 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC154461.2-201ENSMUST00000225462 1980 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Pde2a-212ENSMUST00000211368 3885 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm31135-201ENSMUST00000208460 1782 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Zbtb34-202ENSMUST00000113158 6602 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Mettl8-205ENSMUST00000121586 1151 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm31784-201ENSMUST00000209523 1053 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Optn-201ENSMUST00000027986 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Tuba4a-202ENSMUST00000186213 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms