Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm44503-201ENSMUST00000149692 4383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Flii-201ENSMUST00000002889 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Zkscan1-204ENSMUST00000110963 4670 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Ccrl2-201ENSMUST00000111888 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 4930571K23Rik-201ENSMUST00000166958 2153 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Mamdc4-201ENSMUST00000095117 3990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Pvt1-203ENSMUST00000181657 2798 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Cntrob-201ENSMUST00000092973 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm10302-201ENSMUST00000174433 3535 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Ablim3-202ENSMUST00000166783 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Vrk1-203ENSMUST00000085026 3711 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprtQ99M80 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms