Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Prdm15-201ENSMUST00000095849 6346 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Fmr1-206ENSMUST00000114657 4076 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hecw1Q8K4P8 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hecw1Q8K4P8 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hecw1Q8K4P8 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hecw1Q8K4P8 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hecw1Q8K4P8 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hecw1Q8K4P8 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hecw1Q8K4P8 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hecw1Q8K4P8 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hecw1Q8K4P8 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hecw1Q8K4P8 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hecw1Q8K4P8 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms