Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Kif26b-202ENSMUST00000161017 13749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp47Q8BY87 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Usp47Q8BY87 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Usp47Q8BY87 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Usp47Q8BY87 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Usp47Q8BY87 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Sptbn1-203ENSMUST00000102838 9107 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Usp47Q8BY87 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Usp47Q8BY87 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Usp47Q8BY87 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp47Q8BY87 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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