Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms