Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Arhgap17-204ENSMUST00000205262 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm45903-201ENSMUST00000212891 2898 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Pla2g4d-201ENSMUST00000094665 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Ank3-219ENSMUST00000182437 3113 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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