Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s28-201ENSMUST00000082814 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gzmk-202ENSMUST00000122399 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm7364-201ENSMUST00000188760 1501 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Babam2-203ENSMUST00000114507 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm12962-201ENSMUST00000138697 580 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm24298-201ENSMUST00000158299 60 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Uchl1os-202ENSMUST00000177319 505 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 1190005I06Rik-203ENSMUST00000180677 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm29453-201ENSMUST00000186428 1279 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm29485-201ENSMUST00000190220 282 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam1-204ENSMUST00000205308 993 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Sft2d1Q5SSN7 Gm44649-202ENSMUST00000206896 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Sft2d1Q5SSN7 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC153937.2-202ENSMUST00000219583 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Sft2d1Q5SSN7 Tcstv3-202ENSMUST00000223967 779 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Sft2d1Q5SSN7 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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