Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tgm4-201ENSMUST00000026893 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 A230056P14Rik-201ENSMUST00000130189 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45714-201ENSMUST00000211466 2722 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26902-201ENSMUST00000181307 3100 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox4d-201ENSMUST00000115175 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13188-201ENSMUST00000121150 564 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12318-201ENSMUST00000121235 273 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16150-201ENSMUST00000127620 437 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7784-201ENSMUST00000180769 989 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27150-201ENSMUST00000183441 1038 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27228-201ENSMUST00000184500 1038 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2693-201ENSMUST00000189119 571 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26911-203ENSMUST00000204781 369 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Rps25-204ENSMUST00000216076 393 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC131745.3-201ENSMUST00000223582 554 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Stard13-208ENSMUST00000202111 3373 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 5430416N02Rik-201ENSMUST00000180779 3486 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Patj-207ENSMUST00000107034 4799 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Ilf3-203ENSMUST00000213518 3513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tia1-202ENSMUST00000095753 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Apex2-206ENSMUST00000112727 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36752-201ENSMUST00000220527 1546 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Hbq1b-201ENSMUST00000101387 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22546-201ENSMUST00000104351 130 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15504-201ENSMUST00000119674 265 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13833-201ENSMUST00000146766 719 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15325-201ENSMUST00000149661 697 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8711-201ENSMUST00000163114 883 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 B230311B06Rik-202ENSMUST00000207610 687 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms