Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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