Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Sgsh-201ENSMUST00000005173 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gpatch2-206ENSMUST00000160471 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm42444-201ENSMUST00000199366 4558 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Kif3c-204ENSMUST00000219895 2962 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Psmb11-201ENSMUST00000097177 4247 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Tfcp2l1-201ENSMUST00000027629 9269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Arhgef7-202ENSMUST00000074856 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Sdad1-203ENSMUST00000201143 2156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dnmt1P13864 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms