Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Iglc1-201ENSMUST00000200568 454 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Gm6308-201ENSMUST00000203226 313 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 CT030709.1-201ENSMUST00000214443 443 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 AC100209.1-201ENSMUST00000225562 409 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 AC171241.2-201ENSMUST00000228744 892 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Klk1b11-201ENSMUST00000007156 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Fabp5l2-201ENSMUST00000072582 408 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Defa29-201ENSMUST00000098890 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
P10404 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 B230364G03Rik-201ENSMUST00000181479 1374 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Gm3269-201ENSMUST00000166025 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Pilrb2-201ENSMUST00000164886 1807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
P10404 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Il10ra-201ENSMUST00000034594 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Olfr152-203ENSMUST00000215394 2172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gpr55-201ENSMUST00000086975 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 AC153862.1-201ENSMUST00000215700 3349 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Olfr353-201ENSMUST00000100149 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm12178-201ENSMUST00000120545 330 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm16159-201ENSMUST00000126122 947 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm12925-201ENSMUST00000130791 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm24748-201ENSMUST00000157836 108 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm17138-201ENSMUST00000165702 459 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 1700019P21Rik-201ENSMUST00000186955 411 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm37822-201ENSMUST00000192618 1109 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Ighv8-16-201ENSMUST00000199258 294 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm44148-201ENSMUST00000203718 316 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Thy1-204ENSMUST00000214627 446 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 AC167013.3-201ENSMUST00000228110 989 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Ly6f-201ENSMUST00000023247 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
P10404 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms