Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Mrpl11-201ENSMUST00000025836 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Ttll1-203ENSMUST00000109480 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Oca2-201ENSMUST00000032633 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm26942-201ENSMUST00000182854 797 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Olfr1331-201ENSMUST00000094831 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Tdrd3-205ENSMUST00000170865 2530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Fbxo16-203ENSMUST00000224629 3781 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Cldn34c1-202ENSMUST00000113348 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Synj2-208ENSMUST00000115789 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm45714-201ENSMUST00000211466 2722 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Olfr1564-203ENSMUST00000213642 5271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Olfr1564-205ENSMUST00000215450 5281 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Tdrd1-203ENSMUST00000111606 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm42897-201ENSMUST00000201486 2112 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm3822-201ENSMUST00000201941 2935 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Grm8-201ENSMUST00000090512 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Nrep-203ENSMUST00000171533 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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