Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rrn3B2RS91 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rrn3B2RS91 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rrn3B2RS91 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rrn3B2RS91 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rrn3B2RS91 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rrn3B2RS91 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rrn3B2RS91 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rrn3B2RS91 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rrn3B2RS91 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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