Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Gm5538W4VSP6 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Gm5538W4VSP6 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Gm5538W4VSP6 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms