Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm11760-201ENSMUST00000122355 796 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 H2-Aa-204ENSMUST00000174751 826 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 6530403H02Rik-201ENSMUST00000182099 402 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm43310-201ENSMUST00000198975 820 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 4933407I05Rik-201ENSMUST00000213311 482 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm8623-201ENSMUST00000071573 436 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Rps6-ps2-201ENSMUST00000079841 747 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 D3Ertd751e-207ENSMUST00000146165 3574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rnf4Q9QZS2 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 F730035M05Rik-201ENSMUST00000145871 1296 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rnf4Q9QZS2 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rnf4Q9QZS2 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Rpl22l1-206ENSMUST00000194649 525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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