Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Creb1-202ENSMUST00000087366 8364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26749-201ENSMUST00000181387 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms