Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Tmprss11g-202ENSMUST00000140095 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Trappc12-202ENSMUST00000168129 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Patj-207ENSMUST00000107034 4799 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Btbd16-201ENSMUST00000048453 3434 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Nme8-201ENSMUST00000039340 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Cfap43-205ENSMUST00000160247 5264 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm45629-201ENSMUST00000209629 2546 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm10364-201ENSMUST00000076633 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Triml2-204ENSMUST00000210136 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm10591-201ENSMUST00000178168 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Ccl21b-202ENSMUST00000178864 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Kctd21-201ENSMUST00000054107 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Icosl-201ENSMUST00000105393 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm44986-201ENSMUST00000206292 2829 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Dhx30-202ENSMUST00000111991 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Nip7-201ENSMUST00000034392 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Prkcz-202ENSMUST00000103178 4083 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Sla-205ENSMUST00000168589 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Frk-201ENSMUST00000019913 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm43420-201ENSMUST00000198012 1857 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Sncaip-202ENSMUST00000115410 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 AC117656.3-203ENSMUST00000225007 1809 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm43071-201ENSMUST00000197233 2032 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Nup98-203ENSMUST00000210682 6694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Tsnaxip1-203ENSMUST00000212566 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms