Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Fam166a-201ENSMUST00000028346 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm24145-201ENSMUST00000082631 163 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Adam9-201ENSMUST00000084032 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm8054-201ENSMUST00000093411 483 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Cox7a1-201ENSMUST00000098594 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Olfr1057-201ENSMUST00000099892 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Duxbl3-202ENSMUST00000112340 2248 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Duxbl2-202ENSMUST00000172038 2248 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Thsd1-202ENSMUST00000160585 3276 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Pax9-203ENSMUST00000153250 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 1110019D14Rik-202ENSMUST00000181225 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Prg4-202ENSMUST00000111901 3495 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Nod2-201ENSMUST00000054324 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Acsl6-207ENSMUST00000101213 2730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm15927-203ENSMUST00000148641 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Uros-201ENSMUST00000033276 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Tvp23a-201ENSMUST00000051118 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 AC153526.3-201ENSMUST00000220145 2183 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Pacsin2-202ENSMUST00000165095 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 AC138716.1-201ENSMUST00000226350 2959 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 CT025642.3-201ENSMUST00000225503 4086 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Lancl1-201ENSMUST00000027149 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Tmem175-203ENSMUST00000120327 1811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Ctf2-202ENSMUST00000206038 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Scg2-202ENSMUST00000185234 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 4932438H23Rik-202ENSMUST00000114076 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Mtmr4-202ENSMUST00000103179 5753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Ttyh1-206ENSMUST00000129423 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Ifit1bl1-201ENSMUST00000112467 2193 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm11548-201ENSMUST00000140203 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Pparg-201ENSMUST00000000450 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm11232-201ENSMUST00000084489 1680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Ccser2-207ENSMUST00000182797 1482 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Ccdc141-203ENSMUST00000111833 631 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm12220-201ENSMUST00000118476 172 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm12751-201ENSMUST00000122336 381 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Snhg12-201ENSMUST00000126380 890 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 D730003I15Rik-201ENSMUST00000139056 716 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm15841-201ENSMUST00000160540 517 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm5262-201ENSMUST00000180655 996 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Slc35a5-205ENSMUST00000181177 865 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm26954-202ENSMUST00000182753 762 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm28795-201ENSMUST00000185382 695 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm28611-201ENSMUST00000186429 696 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm28757-201ENSMUST00000186638 696 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm28158-201ENSMUST00000188431 696 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm21823-201ENSMUST00000189122 696 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm28275-201ENSMUST00000189795 695 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm28203-201ENSMUST00000190672 695 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm29607-201ENSMUST00000191009 696 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm29149-201ENSMUST00000191590 696 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm36978-201ENSMUST00000195734 696 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm7824-201ENSMUST00000198301 532 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mkrn3Q60764 AC158603.2-201ENSMUST00000219191 315 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms