Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Gm14377-201ENSMUST00000207045 2094 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Smok3b-202ENSMUST00000166206 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Stat2-202ENSMUST00000105238 4397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Ptafr-201ENSMUST00000070690 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 4931428F04Rik-205ENSMUST00000212922 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Cln3-202ENSMUST00000084589 3203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Thpo-202ENSMUST00000115437 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Clnk-201ENSMUST00000169819 1700 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Clnk-202ENSMUST00000171633 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Atg12-201ENSMUST00000035648 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Osgepl1-202ENSMUST00000114484 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Gm24305-201ENSMUST00000179155 164 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm22513-201ENSMUST00000179621 164 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Cox19-207ENSMUST00000198966 475 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm18485-201ENSMUST00000203788 1114 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm44426-201ENSMUST00000204258 355 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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