Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Supt20-202ENSMUST00000170552 1968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Q3U6N9 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Q3U6N9 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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