Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Trim71Q1PSW8 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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