Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Supt20-202ENSMUST00000170552 1968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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Traf3ip1Q149C2 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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Traf3ip1Q149C2 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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Traf3ip1Q149C2 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms