Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm44014-201ENSMUST00000205150 1509 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms