Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 1700008B11Rik-201ENSMUST00000198145 634 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm11901-201ENSMUST00000120412 437 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Irx1P81068 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Irx1P81068 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms