Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PrkcdP28867 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm7424-201ENSMUST00000206919 902 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm34597-201ENSMUST00000211189 633 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 AC124686.1-201ENSMUST00000225546 522 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms