Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm8529-201ENSMUST00000183298 745 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxraP28700 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RxraP28700 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms