Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm12163-201ENSMUST00000121597 389 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm24063-201ENSMUST00000157491 105 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm24004-201ENSMUST00000158460 178 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm4850-201ENSMUST00000185684 559 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm28530-201ENSMUST00000190473 577 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37108-201ENSMUST00000194605 626 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm43012-201ENSMUST00000198569 937 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 4833412C05Rik-202ENSMUST00000208257 850 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm6329-201ENSMUST00000209210 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm8838-201ENSMUST00000212978 541 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 AC154849.1-201ENSMUST00000224873 960 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm21957-201ENSMUST00000073056 438 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr559-201ENSMUST00000084816 1022 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Zfp750-201ENSMUST00000092298 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Optn-202ENSMUST00000114996 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm44835-201ENSMUST00000205544 3181 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Rpap2-203ENSMUST00000112651 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Clasp1-221ENSMUST00000191823 3916 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Cblb-205ENSMUST00000227756 3378 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Arhgef9-210ENSMUST00000182001 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm38947-201ENSMUST00000209940 2720 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Arl6-201ENSMUST00000023405 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Myo5c-201ENSMUST00000036555 6727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Vmn1r37-206ENSMUST00000228791 1617 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Lrrc28-201ENSMUST00000032775 1817 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr329-ps-201ENSMUST00000108822 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Prdm15-201ENSMUST00000095849 6346 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Adgrl3-208ENSMUST00000118442 5101 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gsk3b-202ENSMUST00000114750 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Babam2-203ENSMUST00000114507 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm14561-201ENSMUST00000117376 798 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm13682-201ENSMUST00000117524 702 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm12780-201ENSMUST00000122458 645 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Tle6-213ENSMUST00000151858 627 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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