Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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CopeO89079 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CopeO89079 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CopeO89079 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CopeO89079 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CopeO89079 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CopeO89079 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CopeO89079 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CopeO89079 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CopeO89079 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CopeO89079 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CopeO89079 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CopeO89079 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CopeO89079 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CopeO89079 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CopeO89079 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CopeO89079 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CopeO89079 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CopeO89079 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CopeO89079 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CopeO89079 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CopeO89079 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CopeO89079 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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CopeO89079 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CopeO89079 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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