Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms