Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms