Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Rab25-201ENSMUST00000008745 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm826-201ENSMUST00000099127 637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm43161-201ENSMUST00000197020 1688 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Serpina1f-201ENSMUST00000021490 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm5975-201ENSMUST00000185256 1399 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Olfr329-ps-201ENSMUST00000108822 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Rhox4d-201ENSMUST00000115175 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm13833-201ENSMUST00000146766 719 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm23021-201ENSMUST00000158765 169 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm3571-201ENSMUST00000170703 1060 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm24325-201ENSMUST00000175344 74 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 1700009J07Rik-201ENSMUST00000178996 912 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm6669-201ENSMUST00000179088 997 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 AF067061-202ENSMUST00000181748 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Fkbp3-202ENSMUST00000220730 579 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 AC165157.2-201ENSMUST00000222265 367 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Borcs8-201ENSMUST00000002418 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm19337-201ENSMUST00000218100 1584 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Paip1-202ENSMUST00000109203 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms