Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm21013-201ENSMUST00000184952 1201 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Cyp19a1-203ENSMUST00000215736 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 A230001M10Rik-202ENSMUST00000196720 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms